R et PMSI

Retour sur les webinaires R et PMSI en 2024

Pour la 2eme année, nous partageons avec la communauté PMSI notre retour d’expérience quant à la participation des professionnels PMSI aux webinaires « R et PMSI » que nous avons organisé en 2024. Voir notre compte-rendu pour l’année 2023.que nous vous invitons à consulter pour l’historique de ces webinaires.

Chiffres 2024 :

# 6 webinaires en 2024, comme en 2023, généralement 1 mois sur 2

# 148 professionnels se sont inscrits, versus 91 en 2023, soit une augmentation de 63% entre 2023 et 2024

# 98 sont venus et ont assisté à tout le webinaire auquel ils s’étaient inscrits, soit une proportion de 66,22% légèrement en baisse par rapport à 2023

# ces 98 professionnels se répartissent, par profession, en 38 médecins DIM, 42 statisticiens (on regroupe ici les statisticiens proprement dits, les data analyst, data scientist, ingénieur hospitalier, …), 15 TIM et 3 Autres

# de manière approximative, comme l’année dernière :
1 participant sur 2 vient en découverte (« je vois bien que c’est l’avenir », « on en parle autour de moi », « est-ce fait pour moi ? », « concrètement comment démarre-t-on ? », « qu’est ce qu’on peut faire en R ? »)
1 participant sur 4 assiste au webinaire car il commence, seul ou en projet dans son établissement, à réaliser quelques manipulations ou analyses simples PMSI en R et a des questions à poser
1 participant sur 4 a déjà bien compris les bénéfices à tout point de vue (productivité, indépendance, performance, coût, partage) de basculer ses analyses PMSI avec R, produit des analyses PMSI en R et vient écouter des bonnes pratiques, participer à la communauté.

Il convient de rester prudent quant à l’interprétation de ces chiffres, compte-tenu de l’échantillon. On peut néanmoins avancer 2 tendances, confirmées de manière qualitative par nos échanges sur ces sujets tout au long de l’année 2024 :

# le recours à R pour analyser son PMSI se développe auprès des professionnels du PMSI ce qui est cohérent avec l’évidente supériorité technique de R par rapport aux solutions propriétaires et au développement de la communauté R et PMSI

# les statisticiens arrivent en force sur la thématique (ils représentaient 31% des participants aux webinaires en 2023 contre 43% en 2024) alors que la proportion de DIM intéressés reste stable.
Opinion : les médecins DIM feraient bien de se mobiliser sur le sujet si ils ne souhaitent pas qu’une part importante de leur mission (et sans doute la plus intéressante) leur échappe à moyen terme au profit des spécialistes de la data médicale.

Copyright © Lespmsi.com – Imprimer cet article

Nouvelle bibliothèque de scripts PMSI R

Nous venons de mettre en ligne, en open source, une bibliothèque de scripts PMSI R.

Elle comprend 15 scripts à ce jour (voir liste ci-dessous). Nous allons régulièrement l’enrichir jusqu’à quelques centaines.

Elle s’adresse à tous les professionnels du PMSI intéressés par l’analyse de données, en premier lieu ceux qui déjà réalisent des analyses en R, mais elle intéressera aussi les autres à titre d’information sur ce qu’il est possible de réaliser aujourd’hui, sans dépendre d’un outillage propriétaire.

Liste de scripts MCO :

# IPDMS par GHM
# Casemix basique séjours par sévérité
# Valorisation T2A des suppléments REA
# Actes CCAM avec extension documentaire obligatoire mais absente
# Nombre de JP d’un séjour MCO

Liste de scripts SMR :
# Casemix basique Intervenant CSARR
# Dépendance physique maximale des séjours HC
# RHS CM 08 d’au moins 5 JP avec 0 acte CSARR
# Rapatriement libellé CSARR
# Nombre de JP par RHS

Liste de scripts PSY :
# Episodes de soin continu par IPP
# IPP avec plusieurs actes de Réunion le même jour
# Séjours temps complet avec entrée et sortie le même jour
# Casemix basique EDGARX
# Rapatriement libellé CIM-10 du DP des RPS

Copyright © Lespmsi.com – Imprimer cet article

Retour sur une année de webinaires R et PMSI

Nous partageons avec la communauté PMSI un retour d’expérience quant à la participation des professionnels PMSI aux webinaires « R et PMSI » que nous organisons régulièrement.

A titre d’expérimentation, sans trop savoir si cela intéresserait des professionnels du PMSI, nous avons proposé un premier webinaire gratuit de découverte intitulé « Débuter avec R pour le PMSI » d’une heure et demi le 16 mars 2023, dans une logique de sensibilisation et de « dédramatisation » de l’approche R pour les analyses PMSI.

Nous avons été agréablement surpris puisque plusieurs dizaines de personnes s’étaient inscrites. Du coup, on propose maintenant ce webinaire régulièrement en améliorant et mettant à jour son contenu au fil des webinaires.

Quelques chiffres sur l’année 2023 :

# 6 webinaires entre mars et décembre 2023
# 91 professionnels se sont inscrits
# 68 sont venus et ont assisté à tout le webinaire auquel ils s’étaient inscrits
# ces 68 professionnels se répartissent, par profession, en 38 médecins DIM, 21 statisticiens (on regroupe ici les statisticiens proprement dits, les data analyst, data scientist, ingénieur hospitalier, …), 7 TIM et 2 Autres
# de manière approximative
1 participant sur 2 vient en découverte (« je vois bien que c’est l’avenir », « on en parle autour de moi », « est-ce fait pour moi ? », « concrètement comment démarre-t-on ? », « qu’est ce qu’on peut faire en R ? »)
1 participant sur 4 assiste au webinaire car il commence, seul ou en projet dans son établissement, à réaliser quelques manipulations ou analyses simples PMSI en R et a des questions à poser
1 participant sur 4 a déjà bien compris les bénéfices à tout point de vue (productivité, indépendance, performance, coût, partage) de basculer ses analyses PMSI avec R, produit des analyses PMSI en R et vient écouter des bonnes pratiques, participer à la communauté.

Copyright © Lespmsi.com – Imprimer cet article

Liste des médicaments anticancéreux intra-GHS : expérimentation 51 (version 2020)

Dans le cadre de l’expérimentation article 51 (voir notre article « Expérimentation article 51 pour le recueil des médicaments anticancéreux« ), certains établissements sont amenés à déclarer les médicaments anticancéreux non-inscrits sur la liste en sus ou intra-GHS.

L’ATIH a publié la version « 2020 » de cette liste de médicaments (format Excel), applicable au 1er janvier 2020 et à déclarer dans le FICHCOMP « anticancéreux intraGHS » (voir notre article « Format du FICHCOMP anticancéreux intraGHS« ).

La liste comprend 3 926 codes indications pour 891 codes UCD différents.

Chaque indication est documentée. La DCI (dénomination commune internationale associée aux codes UCD est présente.

Nous avons ajouté ce nouveau référentiel au package R refpmsi:: des référentiels PMSI avec le libellé « anticancereux_intraghs ». Disponible à partir du 12 décembre 2020.

Source : Médicaments anticancéreux intra-GHS : Expérimentation article 51 (ATIH)

Imprimer cet article – Copyright © Lespmsi.com

Répartition des GHM par UM (code R)

Nous inaugurons une série d’articles « R et PMSI » dans laquelle nous publierons régulièrement des exemples de tableau et de graphiques d’analyse PMSI en R avec mise à disposition du code R commenté.

Sujet : répartition par UM de l’activité, classée par GHM

Commentaires :
Nous avons produit un jeu de données MCO minimal sous R, correspondant à une activité MCO réaliste avec l’essentiel des variables intéressantes (DP, actes CCAM, DAS, durée, GHM, âge, …) et des données correspondant à des codages standards 

Ces variables se retrouvent dans les fichiers rss ou rsa ou sont facilement calculables à partir de celles-ci.

Dans cet exemple, nous avons filtré sur les 10 premiers GHM en terme de nombre de RUM.

La répartition de l’activité classée dans un GHM donné est faite à partir du nombre de RUM.

Tri par ordre décroissant sur le nombre de RUM.

Les référentiels PMSI sont récupérés avec le package refpmsi::

L’analyse peut évidemment être étendue à tous les GHM représentés dans un périmètre d’analyse ou recalibrée à un autre niveau (RGHM, CMD, DA, GP, …) ou sur un regroupement particulier d’UM (par pôle ou par autorisation par exemple).

La mise en forme du tableau reprend l’essentiel des « Ten Guideline for Better Tables » de John Schwabish

Le tableau est produit avec le package gt::

Intérêts :
Visualiser l’adéquation des prises en charge avec les UM
Repérer les prises en charge très majoritairement (> 90%) réalisées dans un UM pour regarder les motifs de réalisations dans les autres UM (cas particuliers justifiés ?, problèmes de codage ?)
Adéquation prises en charge / autorisation

Code R du tableau

Imprimer cet article – Copyright © Lespmsi.com